Ez a Mahou Sensei Negima univerzum folytatása! Miután a világ tudomást szerzett a mágia létezéséről, hatalmas változáson ment keresztül. Ugyanakkor Touta, aki egy félreeső vidéki városban él, nem sokat vett eddig észre ezekből. Átlagos életének fénypontja mágiahasználó tanárnője, és az őt támogató barátai. Ám amikor a békés hétköznapjait megzavarja valami, útra kell, és ezáltal egy különleges kaland részesévé válik.